In concomitanza con le Esposizioni Internazionali di Arti Visive, la Fondazione invita, con cadenza biennale, artisti stranieri riconosciuti a livello internazionale a pensare ad un progetto nuovo partendo dallo spazio, dalla storia e dalle opere della Fondazione Querini Stampalia.
Tra le mostre finora curate, ricordiamo: Artisti per Sarajevo, Nobuyoshi Araki, Boris Mikhailov, Lothar Baumgarten, Ilya & Emilia Kabakov, Kiki Smith.

L’attenzione al confronto tra il passato, così fortemente presente negli spazi della Querini Stampalia, e il pensiero degli artisti del nostro tempo caratterizza invece i progetti che rientrano in "Conservare il futuro", articolato programma di arte contemporanea, sviluppato in collaborazione con la Regione del Veneto ed altri partners.
In questa prospettiva sono stati già presentati i progetti di Giulio Paolini, Elisabetta Di Maggio, Remo Salvadori, Margarita Andreu, Candida Höfer, Giuseppe Caccavale.

Infine, un progetto ormai concluso ma sviluppatosi in un arco di tempo notevole, dal 1998 al 2003, è "SMF 5252" che, in collaborazione con il Consorzio Venezia Nuova, ha promosso piccole mostre capaci di dare visibilità e sostegno alle ricerche più interessanti della cultura contemporanea del nostro territorio, messe a confronto con esperienze nazionali ed internazionali.
Tra le mostre curate: Mauro Sambo, EST. Maya Bajevic, Iliya Chichkan, Christian Tomaszewski, Ferruccio Bortoluzzi, Michelangelo Pistoletto, Ugo Sissa, Nijole Kudirka e Bianca Tarozzi.

Un’altra attività ormai consolidata è "Invito al contemporaneo": cicli d'incontri e di dibattito che, dal 1998, aggiornano sulle tematiche più interessanti della cultura del nostro tempo.

Infine, la Fondazione dedica agli artisti italiani emergenti e alle ricerche creative più nuove del nostro Paese il "Premio FURLA per l'arte" che, dalla Quinta edizione, si avvale della collaborazione della Galleria d’Arte Moderna di Bologna e dalla Sesta edizione dell’appoggio del gruppo Unicredit.